土地革命战争时期，任红四方面军第四军政治部干事，民运科科长，天全独立团营政治教导员。参加了长征。抗日战争时期，任八路军一二九师卫生队政治处副主任，师部特务营政治教导员，晋冀豫边游击纵队政治部组织科科长，正太总队政治处主任，太行军区政治部干部科科长，第三军分区政治部主任。解放战争时期，任太行纵队三支队政治委员，晋冀鲁豫野战军第三纵队七旅，八旅政治委员，第二野战军十一军三十二师政治委员，野战军后勤部政治部副主任。         

土地革命战争时期，他参加了鄂豫皖革命根据地的四次反“围剿”斗争和黄安、苏家埠、潢川、光山等战役战斗，参加了创建川陕革命根据地的斗争和粉碎敌人“三路围攻”、“六路围攻”的战役。长征途中，他三次过雪山草地，两次身负重伤。抗日战争时期，他参加了响堂埔、长乐村战斗，白晋路、正太路战役，反“扫荡”作战和安阳战役及破袭平汉路的战斗。        

中华人民共和国成立后，任西南军区后勤部政治部主任，后勤部副政治委员，中国人民解放军总后勤部卫生部政治委员，总后勤部政治部主任，副政治委员，第二炮兵副政治委员。一九五五年被授予少将军衔。是中国人民政治协商会议第六届全国委员会委员。         

2002年12月22日在北京逝世，享年88岁。胡锦涛、郭伯雄、曹刚川、迟浩田、刘华清、薄一波、赵南起、李德生、张震、洪学智等，分别以不同的方式对卢南樵同志的逝世表示深切哀悼。